История начинается с маленького мальчика по имени Соскэ, который однажды находит на берегу моря золотую рыбку. Он решает назвать её Поньо и заботится о ней, как о своём новом друге. Однако вскоре Соскэ замечает, что с Поньо происходят необычные вещи: она обладает магическими способностями, которые делают её далеко не обычной рыбкой. Всё становится ещё более загадочным, когда появляется отец Поньо — могущественный волшебник, живущий в глубинах океана. Он забирает Поньо обратно в подводный мир, оставляя Соскэ в растерянности.
Поньо, оказавшись в заточении, мечтает стать человеком и вернуться к Соскэ. Её желание настолько сильно, что нарушает баланс природы, вызывая мощное цунами, которое угрожает жизни людей на поверхности. В этот момент становится ясно, что Поньо — не просто рыбка, а существо, связанное с силами природы. Её мать, морская богиня, наблюдает за происходящим и понимает, что только она может восстановить равновесие. Но сможет ли она помочь Поньо осуществить её мечту, не навредив миру?
Финал истории полон волшебства и эмоций. Поньо и Соскэ сталкиваются с испытаниями, которые проверяют их дружбу и веру друг в друга. Морская богиня, видя искренность их чувств, принимает решение, которое меняет судьбу обоих. История о Поньо — это не просто сказка, а глубокий рассказ о любви, мечтах и гармонии между человеком и природой, который оставляет в сердце зрителя тёплые воспоминания.