17-летний Шиничи Кудо — юноша с выдающимся интеллектом, которого друзья и знакомые прозвали "современным Шерлоком". Его способности вызывают восхищение, но однажды его жизнь кардинально меняется. Во время прогулки с подругой детства Ран он становится свидетелем преступления, совершённого членами мафиозного клана. Преступники замечают парня, хватают его и заставляют принять странную таблетку. Не имея выбора, Шиничи проглатывает её и теряет сознание.
Очнувшись, он с ужасом понимает, что его тело уменьшилось до размеров семилетнего ребёнка. Шиничи не может поверить в происходящее, но ему приходится действовать быстро, чтобы скрыться от преследующих его мафиози. Он решает обратиться за помощью к Ран, которая соглашается приютить его. Теперь, живя у неё, он знакомится с её отцом, владельцем детективного агентства. Несмотря на новый облик, ум и навыки Шиничи остаются прежними, и он начинает помогать в расследованиях, одновременно пытаясь найти способ вернуть своё прежнее тело.
Теперь, скрываясь под именем Конан Эдогава, Шиничи продолжает раскрывать сложные преступления, используя свои аналитические способности. Однако его новая жизнь полна опасностей: мафиози всё ещё ищут его, а сам он вынужден балансировать между ролью ребёнка и тайным детективом. Каждое дело приближает его к разгадке тайны таблетки, но также увеличивает риск быть раскрытым. В этой непростой ситуации Шиничи остаётся верен своим принципам, стремясь не только вернуть свою жизнь, но и защитить тех, кто ему дорог.