Академия «Квадратный корень» — это не просто учебное заведение, а место, где студенты погружаются в мир головоломок и загадок. Для главного героя Дзина это место стало настоящим домом, хотя его жизнь сейчас полна трудностей. Он потерял большую часть воспоминаний, и его друзья делают всё возможное, чтобы помочь ему восстановить утраченное. Они верят, что разгадка сложных головоломок может стать ключом к возвращению его прошлого. В один из дней Дзин сталкивается с загадочной девушкой по имени Ростель, чьё появление меняет всё.
Их встреча становится началом череды неожиданных событий. Ростель обнимает Дзина, и он чувствует странное тепло, хотя не может понять, кто она такая. Вскоре становится ясно, что она не случайный человек, а кто-то, кто связан с его прошлым. Её поведение и загадочные действия создают атмосферу таинственности, которая заставляет Дзина и его друзей задуматься. Тем временем друзья оказываются в ловушках, каждая из которых — сложная головоломка, требующая нестандартного мышления. Они понимают, что времени мало, и чтобы спасти Дзина, нужно действовать быстро.
В этот момент в академии появляется Энигма — таинственный незнакомец, утверждающий, что обладает уникальным умом, способным создавать невероятно сложные головоломки. Его появление добавляет новые краски в и без того запутанную историю. Дзин и его друзья оказываются втянуты в череду событий, где каждая загадка приближает их к разгадке тайн прошлого. Но смогут ли они справиться с испытаниями, которые приготовил для них Энигма? Ответ на этот вопрос станет ключом к их будущему.