Во вселенной, где Механизированная империя держит в страхе множество планет, включая Землю, люди больше не хотят мириться с угнетением. На протяжении долгих лет они ведут отчаянную борьбу за свободу, но силы неравны. Тэцуро Хосино, один из участников сопротивления, уже много лет сражается на Земле, но война кажется безнадёжной. Люди терпят поражение за поражением, и Тэцуро начинает терять веру в победу. Однако судьба преподносит ему неожиданный шанс, когда на Землю прибывает легендарный Галактический экспресс 999.
Внезапно Тэцуро получает загадочное сообщение от Мэйтел, которая призывает его вернуться на борт 999-го. Несмотря на опасности, он решает рискнуть и прорывается к станции, где его ждёт поезд. С трудом избежав преследований, Тэцуро оказывается на борту Галактического экспресса, который уносит его в неизведанные дали. Это путешествие станет для него не только шансом на спасение, но и началом нового этапа жизни, полного тайн, приключений и неожиданных открытий.
Галактический экспресс 999 становится для Тэцуро не просто средством передвижения, а символом надежды. Вместе с Мэйтел он отправляется в путь, где каждый новый мир скрывает свои загадки. Их ждут встречи с необычными существами, опасные испытания и моменты, которые изменят их судьбы. Тэцуро предстоит не только бороться за свободу, но и узнать правду о себе, о вселенной и о том, что значит быть человеком в мире, где машины правят всем.
